Showing papers by "Daniel Corach published in 2005"
TL;DR: A collaborative work was carried out by the Spanish and Portuguese ISFG Working Group (GEP‐ISFG) to estimate Y‐STR mutation rates, and longer alleles were found to be more mutable, and the mutation rate seemed to increase with the father's age.
Abstract: A collaborative work was carried out by the Spanish and Portuguese ISFG Working Group (GEP-ISFG) to estimate Y-STR mutation rates. Seventeen Y chromosome STR loci (DYS19, DYS385, DYS389I and II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439, DYS460, DYS461, DYS635 [GATA C4], GATA H4, and GATA A10) were analyzed in a sample of 3,026 father/son pairs. Among 27,029 allele transfers, 54 mutations were observed, with an overall mutation rate across the 17 loci of 1.998 x 10(-3) (95% CI, 1.501 x 10(-3) to 2.606 x 10(-3)). With just one exception, all of the mutations were single-step, and they were observed only once per gametogenesis. Repeat gains were more frequent than losses, longer alleles were found to be more mutable, and the mutation rate seemed to increase with the father's age. Hum Mutat 26(6), 520-528, 2005. (c) 2005 Wiley-Liss, Inc.
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TL;DR: The present edition of the GEP-ISFG exercise has paid special attention to the visual phylogenetic inspection for detecting common sequencing errors, and it is found that edition errors are among the most common mistakes reported by the different labs.
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01 Jan 2005
TL;DR: Agarwal et al. as mentioned in this paper analyzed the contribucion amerindia a la población actual, in particular, en the linajes maternos de Argentina.
Abstract: Argentina es considerada por sus habitantes como el pais mas europeo de America Latina. La supuesta baja densidad aborigen al momento de la conquista y las Campanas al Desierto permitieron considerar que la poblacion de nuestro pais estaba constituida por descendientes de inmigrantes europeos con minimo componente amerindio. El empleo del ADN mitocondrial (ADNmt) y la region no recombinante del Cromosoma Y como marcadores permitieron el rastreo de linajes. Ambos sistemas exhiben caracteristicas especificas en las poblaciones originarias de America. Para analizar la contribucion amerindia a la poblacion actual se seleccionaron 322 muestras de individuos varones no relacionados de nueve provincias agrupadas en tres grupos regionales. Se analizaron HVR I y II de la region de control y la ins/del de Region V del ADNmt, ademas se investigo la presencia de la transicion C-T en el locus DYS199 asi como 9 Y-STRs (DYS19, DYS385, DYS389 I y II, DYS390, DYS391, DYS392 y DYS393). Los resultados obtenidos indican que la contribucion amerindia en los linajes maternos de nuestra poblacion es superior al 50%, en tanto que la contribucion de patrilineas amerindias se restringe al 20%, ademas un 10% de los individuos presentan ambos linajes amerindios. La contribucion no amerindia se restringe a menos del 40%. Los resultados son semejantes en las regiones Nor-Noreste, Centro y Sur-SurOeste. Esta informacion confirmaria investigaciones previas aportadas por el analisis de grupos sanguineos y otros marcadores serologicos. Este trabajo junto con otros aportes permitira replantear la composicion etnica de nuestro pais redefiniendo su identidad.
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