scispace - formally typeset
Search or ask a question

Showing papers by "Tomasz Szczepański published in 2011"


Journal ArticleDOI
TL;DR: More than one third of late T-all recurrences are, in fact, second leukemias, suggesting Germline genetic abnormalities might contribute to the susceptibility of some patients to develop T-ALL.
Abstract: Purpose Relapse of childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) often occurs during treatment, but in some cases, leukemia re-emerges off therapy On the basis of previous analyses of T-cell receptor (TCR) gene rearrangement patterns, we hypothesized that some late recurrences of T-ALL might in fact represent second leukemias Patients and Methods In 22 patients with T-ALL who had late relapses (at least 25 years from diagnosis), we studied TCR gene rearrangement status at first and second presentation, NOTCH1 gene mutations, and the presence of the SIL-TAL1 gene fusion We performed genome-wide copy number and homozygosity analysis by using oligonucleotide- and single nucleotide polymorphism (SNP) – based arrays Results We found evidence of a common clonal origin between diagnosis and relapse in 14 patients (64%) This was based on concordant TCR gene rearrangements (12 patients) or concordant genetic aberrations, as revealed by genome-wide copy number analysis (two patients) In the remaining eight patients (36%), TCR gene rearrangement sequences had completely changed between diagnosis and relapse, and gene copy number analysis showed markedly different patterns of genomic aberrations, suggesting a second T-ALL rather than a resurgence of the original clone Moreover, NOTCH1 mutation patterns were different at diagnosis and relapse in five of these eight patients In one patient with a second T-ALL, SNP analysis revealed a germline del(11)(p12; p13), a known recurrent aberration in T-ALL Conclusion More than one third of late T-ALL recurrences are, in fact, second leukemias Germline genetic abnormalities might contribute to the susceptibility of some patients to develop T-ALL J Clin Oncol 29:1643-1649 © 2011 by American Society of Clinical Oncology

58 citations


Journal ArticleDOI
TL;DR: Statistically significant association between genotype at 7p12.2 (IKZF1), 10q21.2(ARID5B) and the NBS associated locus and ALL risk was found and data provide further insights into the biological basis of ALL.

58 citations


Journal ArticleDOI
TL;DR: A strong association between promoter tandem repeat polymorphism of the thymidylate synthase gene and the relapse frequency was found and it is believed that genotyping for this variant should be performed in patients treated for ALL to enable further optimizing of treatment protocols.

14 citations


Journal ArticleDOI
TL;DR: Cel Celem aktualnej pracy bylo dokladne określenie wartości odsetkowych oraz bezwzglednych komorek ukladu limfoidalnego (subpopulacje linii limfocytow T i NK) the authors krwi obwodowej w populacji dzieci zdrowych.
Abstract: Streszczenie Wstep Ocena poszczegolnych subpopulacji komorek linii limfocytarnej krwi obwodowej ma istotne znaczenie w diagnostyce wielu zaburzen u dzieci. Analiza wynikow i mozliwośc oceny zmian w ukladzie limfoidalnym wymaga znajomości wartości odsetkowych i liczbowych poszczegolnych linii limfocytow określonych dla zdrowej populacji. Cel Celem aktualnej pracy bylo dokladne określenie wartości odsetkowych oraz bezwzglednych komorek ukladu limfoidalnego (subpopulacje linii limfocytow T i NK) we krwi obwodowej w populacji dzieci zdrowych. Material i metoda Badania wykonano za pomocą 6-kolorowej cytometrii przeplywowej u 40 zdrowych dzieci w wieku 3–19 lat. Wyniki Przedstawione w niniejszym opracowaniu mogą posluzyc jako odniesienie do celow kontrolno-porownawczych dla wynikow pacjentow z zaburzeniami w ukladzie immunologicznym w przebiegu roznego typu schorzen. Jest to pierwsza w Polsce publikacja w tak szeroki sposob określająca rozklad wybranych subpopulacji komorek jednojądrzastych krwi obwodowej u dzieci.

5 citations



Journal ArticleDOI
TL;DR: Assessment of the efficacy of two different high doses of methotrexate (HD-MTX) in combination with intrathecal therapy in children with standard risk (SR) ALL as central nervous system (CNS) preventive therapy in a place of cranial radiation found it to be more effective in the treatment of SR ALL in children than HD- MTX in dose 3.0 g/m2.
Abstract: PURPOSE: A non objective randomised, retrospective study was performed to assess and compare the efficacy of two different high doses of methotrexate (HD-MTX) in combination with intrathecal therapy in children with standard risk (SR) ALL as central nervous system (CNS) preventive therapy in a place of cranial radiation. PATIENTS AND METHODS: Between July 1993 and April 2002, in 650 children standard risk (SR) ALL were diagnosed and treated in Poland according to the modified ALL-BFM 90 protocol. Methotrexate was used in the dose of either 3.0 g/m2 (group A) or 5.0 g/m2 (group B) four times in two week intervals during consolidation (protocol M). RESULTS: Probability for 10-year event-free survival (pEFS) and relapse-free survival (pRFS) for all evaluated patients (n = 611) was 0.77 ± 0.02 and 0.82 ± 0.02, respectively. EFS probability for group A (n = 411) was 0.73 ± 0.03 and for group B (n = 200) – 0.85 ± 0.04, whilst RFS probability for group A was 0.79 ± 0.04 and for group B – 0.89 ± 0.03, and these differences proved statistically significant (P = 0.0050 and P = 0.0012). In multivariate analysis, T-cell immunophenotype (P = 0.0046) and age older than 10 years (P = 0.0250) had a significantly adverse impact on the outcome. CONCLUSIONS: HD-MTX used in dose 5.0 g/m2 has been found to be more effective in the treatment of SR ALL in children than HD-MTX in dose 3.0 g/m2.

3 citations



01 Jan 2011
TL;DR: Do transformacji nowotworowej w ostrej bialaczce limfoblastycznej (ALL) dochodzi wskutek co najmniej dwoch nastepujących po sobie mutacji, ktore wspolnie inicjują i promuje leukemogeneze as mentioned in this paper.
Abstract: Do transformacji nowotworowej w ostrej bialaczce limfoblastycznej (ALL) dochodzi wskutek co najmniej dwoch nastepujących po sobie mutacji, ktore wspolnie inicjują i promują leukemogeneze. Spektrum zaburzen struktury zmutowanych genow obejmuje zarowno mutacje punktowe, jak i pekniecia dwuniciowego DNA, prowadzące do translokacji, delecji, inwersji lub duplikacji regionu kodującego. Niektore spośrod odkrytych zaburzen w genomie limfoblast ow mają niezalezne znaczenie prognostyczne stratyfikujące ryzyko niepowodzenia terapii w dzieciecej ALL. W niniejszej pracy omowiono je wraz ze wskazaniem potencjalnych implikacji terapeutycznych opartych na mechanizmach molekularnych Hematologia 2011; 2, 1: 43–50

1 citations


Journal Article
TL;DR: Do transformacji nowotworowej w ostrej bialaczce limfoblastycznej (ALL) dochodzi wskutek co najmniej dwoch nastepujących po sobie mutacji, ktore wspolnie inicjują i promuje leukemogeneze.
Abstract: Do transformacji nowotworowej w ostrej bialaczce limfoblastycznej (ALL) dochodzi wskutek co najmniej dwoch nastepujących po sobie mutacji, ktore wspolnie inicjują i promują leukemogeneze. Spektrum zaburzen struktury zmutowanych genow obejmuje zarowno mutacje punktowe, jak i pekniecia dwuniciowego DNA, prowadzące do translokacji, delecji, inwersji lub duplikacji regionu kodującego. Niektore spośrod odkrytych zaburzen w genomie limfoblast ow mają niezalezne znaczenie prognostyczne stratyfikujące ryzyko niepowodzenia terapii w dzieciecej ALL. W niniejszej pracy omowiono je wraz ze wskazaniem potencjalnych implikacji terapeutycznych opartych na mechanizmach molekularnych Hematologia 2011; 2, 1: 43–50

1 citations